Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEC22CQ9BRL7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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