Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TOPBP1Q92547 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TOPBP1Q92547 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms