Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDK2Q58EX2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDK2Q58EX2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms