Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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