Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C1orf61Q13536 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C1orf61Q13536 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms