Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MRPL28Q13084 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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