Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSRP1Q08945 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms