Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLCSP50747 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLCSP50747 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLCSP50747 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLCSP50747 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLCSP50747 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLCSP50747 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLCSP50747 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLCSP50747 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLCSP50747 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms