Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms