Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT6CP48668 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms