Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMPOP42166 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMPOP42166 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMPOP42166 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms