Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms