Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms