Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT3P12035 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRT3P12035 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms