Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFMP07197 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFMP07197 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFMP07197 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFMP07197 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFMP07197 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFMP07197 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEFMP07197 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms