Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms