Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN25C9JDP6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN25C9JDP6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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