Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KLF12Q9Y4X4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms