Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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COPS3Q9UNS2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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COPS3Q9UNS2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPS3Q9UNS2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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