Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRP68Q9UHB9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRP68Q9UHB9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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