Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK-18Q9QC07 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-18Q9QC07 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms