Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KLHL42Q9P2K6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms