Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USP36Q9P275 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms