Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms