Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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FOXQ1Q9C009 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXQ1Q9C009 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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