Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms