Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PI4K2AQ9BTU6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms