Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX29P2Q8IUI4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms