Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms