Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CATSPEREQ5SY80 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms