Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HIST3H3Q16695 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HIST3H3Q16695 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HIST3H3Q16695 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HIST3H3Q16695 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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HIST3H3Q16695 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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HIST3H3Q16695 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HIST3H3Q16695 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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