Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SNAPC1Q16533 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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