Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITSN1Q15811 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms