Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFIXQ14938 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFIXQ14938 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFIXQ14938 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFIXQ14938 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NFIXQ14938 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NFIXQ14938 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NFIXQ14938 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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