Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCARF1Q14162 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SCARF1Q14162 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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