Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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NAE1Q13564 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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