Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.357e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.077e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.37e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.497e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.717e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.737e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.737e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.747e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.747e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.787e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MBNL1-222ENST00000497971 5051 ntTSL 1 (best)1.34□□□□□ -2.27e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.354e-12■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.964e-12■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 BCAT1-207ENST00000543099 568 ntTSL 45.75□□□□□ -1.494e-12■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SNF8-213ENST00000514929 775 ntTSL 529.56■■■□□ 2.322e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SNF8-205ENST00000507302 742 ntTSL 320.4■□□□□ 0.862e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-33■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 TPT1-211ENST00000530245 530 ntTSL 35.91□□□□□ -1.464e-45■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.033e-11■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.71e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.461e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ZNF444-204ENST00000587236 5565 ntTSL 217.6■□□□□ 0.411e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 RPL8-203ENST00000525232 1007 ntTSL 1 (best)25.59■■□□□ 1.691e-36■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.741e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-206ENST00000476464 2052 ntTSL 218.43■□□□□ 0.541e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-203ENST00000463139 2621 ntTSL 28.93□□□□□ -0.981e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-204ENST00000467853 4583 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.311e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.41e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMD6-208ENST00000480205 657 ntTSL 36.28□□□□□ -1.41e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.993e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.322e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.42e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PSMC6-209ENST00000555175 752 ntTSL 36.22□□□□□ -1.412e-10■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 RPS7-209ENST00000491937 987 ntTSL 232.29■■■□□ 2.761e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.941e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.595e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.5■□□□□ 0.235e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.055e-9■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 TRIM28-206ENST00000595974 665 ntTSL 319.46■□□□□ 0.712e-8■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PDLIM7-208ENST00000493815 1686 ntTSL 1 (best)20.96■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 PDLIM7-207ENST00000486828 1904 ntTSL 1 (best)19.84■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 TBC1D10B-203ENST00000475650 2484 ntTSL 217.17■□□□□ 0.341e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 TBC1D10B-205ENST00000478158 4614 ntTSL 214.13□□□□□ -0.151e-7■■■□□ 14.6
PABPC4Q13310 SSNA1-203ENST00000463511 570 ntTSL 228.46■■■□□ 2.152e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIP10-204ENST00000595319 776 ntTSL 527.67■■■□□ 2.022e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIM14-206ENST00000478530 982 ntTSL 527.64■■■□□ 2.022e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.92e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIP10-211ENST00000600491 1493 ntTSL 226.3■■□□□ 1.82e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.712e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.652e-8■■□□□ 14.5
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PABPC4Q13310 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.572e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.562e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.392e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.862e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.592e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIP10-207ENST00000596673 586 ntTSL 318.03■□□□□ 0.482e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TOR2A-206ENST00000472723 3496 ntTSL 217.93■□□□□ 0.462e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 CARHSP1-209ENST00000567626 350 ntTSL 517.26■□□□□ 0.352e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.332e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 TRIP10-205ENST00000596078 1010 ntTSL 515.15■□□□□ 0.022e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.242e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.322e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 MRPS18C-204ENST00000507019 666 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.364e-23■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.372e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-201ENST00000378180 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 POLDIP3-201ENST00000252115 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.452e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 POLDIP3-203ENST00000348657 3323 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 POLDIP3-205ENST00000451060 3491 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.472e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 EIF1AD-204ENST00000526451 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 AL450405.1-201ENST00000443998 474 ntBASIC12.02□□□□□ -0.492e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 HARS-211ENST00000509087 619 ntTSL 211.54□□□□□ -0.562e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.652e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 CD99-201ENST00000381177 756 ntTSL 210.87□□□□□ -0.672e-8■■□□□ 14.5
PABPC4Q13310 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-8■■□□□ 14.5
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