Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRJQ12913 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PTPRJQ12913 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRJQ12913 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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