Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOBRQ0VD83 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOBRQ0VD83 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms