Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DHX9Q08211 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms