Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB3Q05901 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms