Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPARDQ03181 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPARDQ03181 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms