Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDR2Q01850 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms