Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-21P61565 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-21P61565 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms