Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC01547P58512 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC01547P58512 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms