Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GBX2P52951 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms