Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPGP40121 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms