Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2IP36954 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms