Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms