Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFNP31947 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFNP31947 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFNP31947 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFNP31947 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms